滑膜囊肿，采用口服及外用药物治疗是无效的。因为囊肿会有一个较厚的囊壁（其内包裹纯净的关节滑膜液），这个囊壁会阻断周围的血运，使囊肿内没有正常血供，则造成药物很难达到囊肿之内。此外也没有什么特效药物，可以促进囊肿内积液的吸收和囊壁的修复。如果滑膜囊肿较小，一般不处理；如果囊肿较大，可以行穿刺、抽吸滑膜炎；如果治疗无效或囊肿影响活动，可以考虑手术，根据囊肿的不同部位采用关节镜或者是正常切开手术治疗。