骨肿瘤的分类可以按照细胞的来源、病因、肿瘤生物学进行分类。骨肿瘤一般按照病因，可以分为原发性骨肿瘤、继发性骨肿瘤和转移性的骨肿瘤。如果按照肿瘤的生物学行为进行分类，良性的骨肿瘤比较常见的是骨软骨瘤、骨样骨瘤、骨巨细胞瘤、纤维结构不良等。恶性肿瘤主要包括骨肉瘤、软骨肉瘤、骨髓瘤、恶性淋巴瘤等。瘤样性病变比较常见的有骨囊肿、嗜酸性肉芽肿等。在临床上，也可以按照细胞的来源进行分类。主要包括，⑴软骨来源：软骨瘤、软骨母细胞、软骨肉瘤等。⑵骨来源：骨瘤、骨样骨瘤、骨肉瘤等。⑶纤维来源：非骨化纤维瘤、纤维结构不良、纤维肉瘤等。⑷造血来源：骨髓瘤、淋巴瘤等。⑸血管来源：血管瘤、血管肉瘤、恶性血管外皮瘤等。⑹脂肪来源：骨内脂肪瘤、骨内脂肪肉瘤等。⑺其他类型的包括：骨囊肿、动脉瘤样骨囊肿、骨巨细胞瘤等。