阿戈美拉汀副作用主要有以下几点：第一点，病人在应用过程中最为多见的是恶心、头晕。一般为一过性，很少造成治疗中止。第二点，可能对肝胆系统产生影响。例如可见肝功能升高以及罕见肝炎的发生。第三点，对于精神产生一定影响。可能表现为焦虑、自杀行为或者自杀念头、躁狂、易激惹、梦境异常等。第四点，可能对皮肤以及皮下组织产生影响，例如皮疹、瘙痒、多汗等表现。