酪酸梭菌活菌胶囊用于因肠道菌群紊乱而造成的各种消化道症状，及相关的急、慢性腹泻和消化不良等。酪酸梭菌对氨苄青霉素、头孢唑啉、头孢呋辛、四环素、氯霉素、痢特灵、复方新诺明和氟哌酸等敏感，和此类抗菌药同时服用可减弱其疗效，应分开服用。