膝盖囊肿是不会自己消失的。膝盖囊肿大多数都是外伤或者是慢性劳损导致的，是滑膜损伤后渗出形成的囊肿，不治疗是不可能自己消失的。病人应当到正规的公立医院检查，可以采取穿刺抽液的方法进行治疗，如果疾病反复发作，也可以采取手术的方法切除囊肿治疗。