肺炎衣原体阳性说明有衣原体感染的情况。衣原体是一种没有细胞壁的病原微生物，所以不可以选择应用β内酰胺类的抗菌的药物治疗，选择抑制蛋白质合成，或者抑制DNA合成的抗生素治疗，例如大环内酯类的抗生素或氟喹诺酮类的抗生素，以及林克霉素类的抗生素，或者四环素类药物治疗。