结肠炎的治疗取决于类型。若是特异性结肠炎，如溃疡性结肠炎，治疗时可能需要使用免疫抑制剂治疗，如柳氮磺吡啶或柳氮磺吡啶治疗，同时可以结合中药灌肠治疗。若是非特异性结肠炎，如急性慢性结肠炎，治疗主要是改善生活习惯。