红斑狼疮的起病原因不明确，医学上也认为可能跟遗传有关系。但是并不将其归为遗传病。有很多研究表明，系统性红斑狼疮有遗传倾向性及家族发病聚集性的特点，当家庭中某一位成员患系统性红斑狼疮。和其他成员的发病率显著增加。比普通人群的发病率高几十倍。同卵双生双胞胎的系统性红斑狼疮，发病一致率为25~70%。明显高于异卵双生。另有研究表明父母有患系统性红斑狼疮，其子女的发病率也是不一样的。女性更容易罹患此病，约有10%，儿子约有2%的机会得系统性红斑狼疮。