真菌性角膜炎可以使用抗菌药物进行治疗。主要有局部和口服用药两种。其中抗真菌眼药水包括那他霉素或者咪康唑眼药水等，口服的药物包括氟胞嘧啶或者二性霉素B等。因为真菌性角膜炎大多是致病菌感染造成的，因此很容易造成视力下降。病人需要及时到眼科做相关检查，病因确定后，采取相应的措施治疗。治疗期间，还要保护好眼睛，定期做好复查。