一般来说如果小肚子隐隐作痛的话，可能是由于胃肠道里面的疾病，可能是内科里面的消化不良或者是结肠炎等等，若是女性的话，小肚子隐隐作痛，可能是由于慢性的盆腔炎或者是子宫内膜异位症，除此之外还有可能是子宫肌瘤。需要去医院就医明确病因。