射精后尿道疼痛原因归纳起来有两个方面：第一、可能是尿道本身功能方面问题，在射精之后，由于强烈收缩造成尿道痉挛。尿道痉挛以后会表现出痉挛疼痛。这种情况下就会疼痛，一般来说，就是过一会，它能自行缓解。第二、就是本身生殖系统，它有些疾病，比如：尿道炎，尤其是后尿道炎症。因为射精管开口于前列腺的部位，跟后尿道相关，这时如果产生射精的时候，它因为尿道或者前列腺这个部位有炎症刺激，射精之后刺激就会更加明显，于是就产生疼痛感觉。这种情况下产生疼痛，往往短时间内，它不能消失，可能需要比较长期，才能慢慢减轻。因此碰到这种情况，应当上医院进行检查，进行相应治疗，把炎症治好以后，然后再去过性生活。