服用治疗幽门螺杆菌的药可能会表现出以下的副作用，比如服用奥美拉唑等质子泵抑制剂药物，会表现出恶心、呕吐、腹胀、嗳气、胃痛、反酸、烧心等副作用；如果服用铋剂，病人的大便的颜色会发黑；若病人对药物过敏，还会表现出皮肤红疹、皮肤瘙痒等不良症状。如果病人表现出比较严重的副作用，建议病人遵医嘱换一种药物治疗，避免加重胃肠的负担。此外，病人要保持饮食的清淡，最好不要吃辛辣和刺激的食物。