氨糖软骨素是治疗骨关节退行性改变的一种常用药物，一般需要长时间服用才能发挥其作用。由于可以长时间服用，所以其副作用对人体的损害并不十分大。但是长时间大量的服用，对一些特殊人群也会导致一些不适，如对于一些胃肠道功能本来就存在问题的老年病人，氨糖软骨素会刺激胃肠道，影响其吸收和消化，可能会导致胃脘部的酸胀不适等，有的会导致局部胃脘的疼痛。此外，孕妇及儿童是不适合服用氨糖软骨素的。