人体的消化器官主要可有食管、胃、小肠、大肠、肝脏、胰腺等，但小肠及大肠又可细分为十二指肠、空肠、回肠和盲肠、阑尾、结肠、直肠、肛门等部分。此外，完整的消化系统还包含食管以上的口腔、咽等及其他各类参与消化进程的腺体如腮腺、下颌下腺、舌下腺、贲门腺、胃底腺、幽门腺、肠腺、十二指肠腺等。而胆囊分泌的胆汁虽然也有促进食物消化的作用，但其本身并无消化食物的生理功能，故并非为消化器官，仅可作为胆汁的储存脏器。