肾脏结石的病因很复杂，肾结石的形成与患者的饮食、喝水、电解质代谢、是否存在慢性的感染等原因有关系。经常的饮用硬水的人群，饮用的水中镁钙含量较高，发生结石的概率较高。长时间的摄入富含高草酸的食物、以及高嘌呤的食物，会导致患者有肾脏结石出现。若是患者自身有慢性的尿路感染、或者过度补钙治疗，会造成尿钙升高的患者，也比较容易发生有肾结石。