中国中医科学院的中医针灸师证书，在中国的卫生健康领域内，是具有高度权威性和专业性的证明，该证书的发放机构——中国中医科学院，是中国最高级别的中医药科研机构，其在中医药领域的研究和教育水平均处于国内领先地位，由其颁发的针灸师证书，无疑是技术能力和专业素质的重要凭证。

是否被卫生局认可，可能需要具体问题具体分析，在中国，各地区的卫生行政管理可能会有所不同，对于各类专业技术人员的资格认证要求也会有所差异，国家级的专业技能证书如中国中医科学院的针灸师证书，大部分地区和单位都会予以承认，但为了确保无误，建议持证者在特定工作地或申请执业许可时，提前向当地卫生局或者相关管理部门咨询确认。

值得注意的是，除了证书本身，实际操作能力、临床经验以及持续的专业学习也是卫生部门评估专业人员能力的重要因素，针灸师不仅要有扎实的理论知识，更需具备丰富的实践经验和良好的医德医风，这些都是获得患者信任和卫生局认可的关键。

中国中医科学院的中医针灸师证书在行业内具有极高的含金量，但在具体应用中，还需要结合地方政策和行业规范进行确认，持证者应不断提升自我，以全面的专业素养赢得社会的认可。