在填写针灸师证颁发部门时，首先需要明确的是，针灸师的资格认证和证书发放是由国家相关部门进行管理的，在中国，针灸师的职业资格认证主要由卫生健康部门负责。

具体来说，在中国大陆，针灸师证书的颁发部门通常为人力资源和社会保障部以及中华人民共和国国家中医药管理局，这两个部门共同制定并实施了《中医医师资格考试办法》和《中医类别医师执业注册管理办法》，对针灸师的教育、培训、考核及执业注册等环节进行了全面的规定。

人力资源和社会保障部主要负责全国专业技术人员职业资格制度的政策制定、指导监督和综合协调工作，包括针灸师在内的各类医疗专业人员的职业资格认证都在其监管范围内。

而国家中医药管理局则作为国务院主管全国中医药工作的直属机构，主要负责中医药的管理工作，包括中医药人员的教育培训、资格认定、执业注册等工作，针灸师的专业技术资格评审和证书发放，就直接归口于这个部门。

在填写针灸师证颁发部门时，可以按照实际情况选择“人力资源和社会保障部”、“国家中医药管理局”或者两者皆可，以体现证书权威性和合法性，不过，具体的填写要求可能会因地区或时间的不同而有所差异，建议根据实际申请表的要求进行填写，或者直接咨询相关发证机构获取最准确的信息。