在当前的医疗体系中，持有高级中医针灸师证书的人是否能够合法行医，主要取决于国家或地区的相关法规，在中国，根据《中华人民共和国执业医师法》的规定，无论是西医还是中医，包括针灸师在内，要想合法行医，都必须取得相应的医师资格证书和执业证书。

高级中医针灸师证书，一般是由相关部门或者权威机构颁发的专业技能认证，证明了持证者在中医针灸领域的专业水平和实践能力，这并不等同于医师资格证书，后者是对医生临床诊疗能力的全面评估，并且是合法行医的法律依据。

要获取中国的中医医师资格，通常需要经过一系列严格的步骤：完成中医药高等教育，如中医药大学的本科或研究生课程；通过全国统一的医师资格考试；进行一定年限的实习并获得医疗机构的聘用，再通过执业医师注册，才能正式成为合法的中医医师。

至于如何考取高级中医针灸师证书，通常流程如下：

1、基础学习：参加相关的针灸技能培训课程，学习中医理论、针灸基础及各种操作技术。

2、技能考核：在培训过程中，会有专业的技能考核，以确保学员掌握必要的技能。

3、申请证书：完成所有课程并通过考核后，向相关机构或协会提交申请，提供相关证明材料，如学历证明、培训证书等。

4、审核与发放：审核通过后，将会收到高级中医针灸师证书。

尽管这个证书可以展示你的专业技能，但为了合法行医，你还需要按照上述步骤获取医师资格证书，这样，你既能运用高级针灸技术，又能在法律许可的范围内为患者提供医疗服务。