中医高级针灸师证书的持有者在理论上是可以在医院工作的，这主要取决于医院的需求以及个人的专业技能和经验，在中国，中医高级针灸师证书是由国家卫生健康委员会颁发的，它代表了持证人在中医针灸领域的专业水平和临床能力，具备此证书的人员通常能够独立进行疾病的诊断和治疗，包括运用各种针灸技术、中药等手段。

是否能在医院工作并获得多少年薪，这并非仅仅由证书决定，还受到许多其他因素的影响，医院对员工的需求量，你的实际操作能力和临床经验，所在地区的经济状况，医院的规模和级别，甚至还有个人的谈判技巧等等，大型三甲医院或者专业的中医院可能会提供更高的薪酬，一线城市和发达地区的医院薪酬普遍高于二三线城市或欠发达地区。

至于年薪的具体数额，这是一个广泛波动的范围，初级的中医针灸师可能年薪在5万到10万元人民币之间，而有丰富经验和较高专业技术的高级针灸师，年薪可能达到20万至50万元人民币，甚至更高，但请注意，这些数据仅供参考，实际情况会因人而异，具体薪资应以与医院签订的合同为准。

中医高级针灸师证书是你进入医疗行业的一个重要敲门砖，但具体的就业机会和薪资待遇还需综合考虑个人能力、市场环境以及职业规划等多种因素，持续提升专业素养，增强临床实践能力，是确保在竞争激烈的医疗领域立足的关键。