针灸师证书是由中国政府相关卫生管理部门或授权的专业机构颁发的，在中国，主要由国家卫生健康委员会（原中华人民共和国卫生部）及其下属的省级卫生健康委员会负责管理与认证，中国中医药管理局也会参与对中医类别包括针灸在内的专业技术人员进行资格认定。
具体流程通常如下：个人需要完成正规的中医学教育，包括针灸理论和实践的学习，并通过相关的考试以获取学习证明或者学位，他们需要在医疗机构进行临床实习，积累一定的实践经验，接下来，参加由国家卫生健康委员会组织的全国统一的中医执业医师资格考试，其中包括针灸部分的考核，考试合格后，将获得《中医执业医师资格证书》，持该证书到当地卫生健康行政部门申请注册，领取《中医执业医师执业证书》，才能合法从事针灸诊疗工作。
在国外，针灸师的资质认证则根据各国和地区的规定有所不同，在美国，许多州要求针灸师必须通过National Certification Commission for Acupuncture and Oriental Medicine (NCCAOM) 的考试并取得认证，而在澳大利亚、加拿大等国，也有相应的针灸行业协会或专业认证机构来管理和颁发针灸师资格证书。
针灸师证书的颁发单位取决于所在国家或地区的法律法规，但其核心目标都是确保提供给公众的是安全且专业的医疗服务。
