中医针灸师的资格证书是由中国政府相关机构颁发的，在中国，这个权威的颁发单位是国家卫生健康委员会（原为中华人民共和国卫生部），国家卫生健康委员会是中国政府主管全国医疗卫生与健康事业的工作部门，其职能包括制定并实施医药卫生工作的方针、政策和法规，管理医疗机构，以及对各类医疗专业人员进行资质认证等。

具体到中医针灸师的资格认定，其流程通常包括理论学习、实践操作、并通过由国家卫生健康委员会组织或授权的相关考试，通过考核后，由该部门颁发《中医执业医师资格证书》或者《中医助理医师资格证书》，这两个证书都是合法行医的重要凭证，也是中医针灸师职业身份的官方证明。

持有这些证书的中医针灸师可以在合法的医疗机构中从事中医针灸诊疗工作，为患者提供专业的中医针灸服务，这也体现了我国对中医药行业的规范化管理，保证了公众的就医安全，也提升了中医针灸这一传统医学技艺的专业性和公信力。

国家卫生健康委员会作为中医针灸师资格证书的颁发单位，不仅维护了行业秩序，也为保护和传承中医药文化，推动其现代化发展起到了关键作用。