在中国，针灸师的资格认证是由国家卫生健康委员会（原卫生部）和人力资源和社会保障部共同管理的，具体来说，针灸师的职业技能鉴定是由中国健康管理协会等专业机构执行，而执业医师的注册则由地方卫生健康行政部门负责。

国家卫生健康委员会是负责全国医疗卫生工作的最高行政机构，其下的中医药管理局专门管理中医、中西医结合及民族医药工作，包括针灸师的培训与考核标准的制定，人力资源和社会保障部主要负责职业技能的认定和证书的发放，确保了针灸师的专业性和技术能力得到权威认可。

获得由这两个部门联合认证的针灸师证书无疑是最具权威性的，这样的证书不仅代表了持证人具备扎实的理论知识和精湛的操作技巧，也表明他们遵循了严格的行业规范和职业道德，能够为患者提供安全有效的医疗服务。

一些知名的教育机构如北京中医药大学、上海中医药大学等也会提供针灸相关的学历教育和职业培训，他们的证书在行业内也有很高的认可度，但请注意，这些证书不能替代国家卫生健康委员会和人力资源和社会保障部颁发的正式执业证书，后者是合法行医的重要凭证。

选择接受正规院校教育，通过国家统一考试获取的针灸师证书，将是最佳的选择，这既是对个人职业生涯的长远投资，也是对患者健康权益的有力保障。