中医针灸师证书的考试科目主要依据其专业层次和认证级别而定，目前，中国对于中医针灸师的资格认证主要包括初级、中级和高级三个等级，每个等级的考试科目都有所不同。

初级中医针灸师的考试科目通常包括基础理论知识、临床技能操作和法律法规三大部分，基础理论知识部分涵盖中医基础理论、经络腧穴学、刺法灸法学等内容；临床技能操作部分则需要考生掌握各种针灸手法的实际应用，如毫针、电针、拔罐等；法律法规部分则是为了确保从业者了解并遵守相关的医疗法规和职业道德。

中级中医针灸师的考试在初级的基础上增加了更深入的专业知识和临床实践能力的考核，这可能包括对特定疾病的诊断与治疗方案设计，以及对复杂病例的分析处理能力，也会涉及到科研能力和继续教育的学习情况。

至于高级中医针灸师的考试，则更侧重于对考生临床决策能力、疑难杂症的处理能力以及教学、科研水平的评估，还有可能考察其在学术研究领域的贡献，如发表的论文、主持的项目等。

无论是哪个级别的中医针灸师考试，都强调理论与实践的结合，注重对中医基本理论的理解，同时也重视临床实际操作技能的考核，通过这样的考试，可以保证每一位获得证书的中医针灸师具备扎实的理论基础和丰富的实践经验，能够为患者提供高质量的医疗服务。