胆碱酯酶偏低的原因有肝细胞受损害时，胆碱酯酶合成减少是造成血清胆碱酯酶偏低的原因。临床上主要用于估计肝脏的储备功能和肝病的预后。急性肝炎时胆碱酯酶下降，至极其达到最低值，然后渐升，若胆碱酯酶一直降低则提示预后不良。肝外疾病造成的胆碱酯酶偏低；如：有机磷农药中毒酶活力显著降低、营养不良、恶性贫血等。