按照人体正常的解剖结构，十二指肠大乳头，是胆汁排放口。而十二指肠位于胃的下游。之间有幽门括约肌，避免十二指肠内容物反流入胃。因此胆汁反流最多见的原因是，各种原因导致的幽门括约肌功能障碍。如胃大部切除术，毕II式比毕I式更易发生胆汁反流。因为，毕II式是胃空肠吻合，改变了正常的生理结构。对于胃大切术后导致的胆汁反流，可行Roux-en-Y术式。此外胃肠蠕动减慢，十二指肠肠内容物，无法下排，也可以导致胆汁反流，可用一些促进胃肠蠕动的药物。