肺栓塞的治疗采用分层方法治疗高危、中、低风险病人，同时也可以使用手术方法、溶栓法和抗凝法。现阶段溶栓治疗主要采用尿激酶，但存在颅内出血等过度出血的危险，消化道出血病人不能接受溶栓治疗。对于抗凝血，使用抗凝药物，包括肝素或低分子量肝素注射药物，以及口服抗凝药物，高危病人可以经过手术治疗。