肛瘘本身并不会对病人造成很大损伤，但是如果发生感染，有可能造成脓毒败血症严重并发症的发生，甚至威胁病人的生命。肛瘘本身并不会对病人造成很大损伤，主要表现为外瘘口流脓，脓液多少取决于炎症的情况。第二个就瘙痒，肛周皮肤受脓液长时间刺激，致湿疹样改变，甚至造成皮炎样改变。第三个就是疼痛，一般肛瘘当引流不畅、积脓时造成的炎症，局部可以表现为红肿热痛，同时可以合并感染中毒症状。第四个，就长时间化脓的复杂肛瘘可伴随贫血、消瘦、食欲不振等。但如果发生感染，浅表脓肿主要表现为局部红肿热痛和轻微的全身感染中毒症状，病人体征明显，容易诊断和处理。而深部脓肿则表现为局部红肿热痛轻，但全身感染中毒症状重，病人局部体征不明显，很容易误诊。一般的有时严重，可以造成脓毒败血症严重并发症的发生，甚至威胁病人的生命。肛瘘病人应当对该疾病高度认识，早期诊治，防止严重并发症发生。