男性生殖器官上长痘痘最多见于阴茎皮肤毛囊感染形成的毛囊炎，又称毛囊粉刺，常常由于毛囊发生各种致病微生物感染导致的，需要用碘伏等外用药物局部涂抹治疗。还见于生殖器单纯疱疹病毒感染造成，疱疹病毒感染会表现出局部红肿像脓疱样的皮疹，常常伴随疼痛症状。还见于男性带状疱疹病毒感染导致的，男性带状疱疹病毒感染会造成剧烈的疼痛，会造成阴茎表面脓性破损，会表现出渗出和少许分泌物，患者常会疼痛难忍。