在临床上用于治疗肠炎的药物非常多，有西药，有中药，有中成药物，选择需要根据肠炎的性质。急性肠炎而导致的腹痛腹泻是由于细菌感染引起，可以在医生的指导下，选择敏感的抗生素进行治疗。如果是慢性溃疡性结肠炎，依据严重程度的不同，选择美沙拉嗪、柳氮磺吡啶，激素等药物进行治疗。也可以结合应用中药，中成药物综合调理。常用的有参苓白术散加减，健胃消食片，保和丸等。