气管镜检查是有一定痛苦的，尤其是普通的气管镜检查，会对病人导致一定程度的痛苦。病人有可能会表现出一咽喉部的疼痛，有可能会表现出恶心的症状，很有可能会表现出气道的痉挛，会表现出胸闷、呼吸困难的症状，也有可能会表现出剧烈的咳嗽症状。甚至有些病人不能够耐受普通气管镜的检查，需要进行全麻下的气管镜或者说无痛气管镜的检查；多数的病人对于无痛气管镜检查是能够耐受的。但是如果病人存在一些心肺的基础疾病，这种情况下全麻是有一定风险的，对于这种情况是不提倡进行全麻气管镜的。