月经不干净总是褐色的，要考虑有可能是子宫内膜异位症所造成的。此外也不排除是由于激素水平发生紊乱，或者是因为其他妇科疾病所造成的在临床上，黏膜下子宫肌瘤或者子宫内膜息肉都可以造成褐色分泌物。因此建议应当及时的进行检查，确定具体病因后针对性治疗。同时建议应当做阴道镜检查确定出血的部位，也不能排除是因为子宫颈糜烂所造成的。