按照新的前列腺炎分类方法，慢性无菌性前列腺炎和慢性盆腔疼痛综合征，统称为三型前列腺炎。三型前列腺炎的临床症状主要包括疼痛和排尿异常。疼痛的部位局限于耻骨上会阴肛周和腰骶部，大致相当于男性三角内裤覆盖的区域。由于疼痛的程度难以准确表达。现在临床上使用慢性前列腺炎症状指数来量化评价，根据程度分为0到10分。排尿异常主要为尿频尿急及排尿困难。有些人还会出现性功能减退，焦虑抑郁等精神心理症状。