会厌囊肿正常情况下是需要手术治疗的。如果囊肿比较小时，也可以注意观察定期复查，如果没有明显的症状，不需要特殊处理。如果囊肿进一步增大，影响呼吸或者是导致咽部异物感等表现时，就得要进行手术治疗，正常情况下需要全麻在支撑喉镜下进行手术，将囊肿切除。