大补阴丸用来治疗肝肾阴虚，虚火亢盛，骨蒸潮热，盗汗或咳嗽咳血以及烦热易肌，耳鸣盗汗，足膝痛热，舌红少苔，脉数等症。在现代医学中常用于肺结核、糖尿病、以及慢性肾炎和更年期综合症以及血尿和血栓闭塞性脉管炎等属于阴虚内热者，也可以用于阴虚烦躁、心悸、失眠、盗汗等症。