坏死性肠炎的病因有三个方面，第一是感染性因素，一些病菌感染肠道黏膜，破坏肠黏膜屏障，造成肠道黏膜表现出坏死病灶。这些病灶呈密集点状分布或片状分布，范围较广，造成大面积肠黏膜坏死。第二是缺血性因素，比如肠系膜静脉血栓，由于肠道黏膜血液循环障碍，肠黏膜缺血坏死，表现出腹痛、便血等情况。第三是肠梗阻性因素，如肠扭转患者，也会表现出肠黏膜坏死的病理改变。