就发病机理而言，益生菌对乳糖不耐受患儿是没有用的。乳糖不耐受是儿科常见情况，多见于1岁以下婴幼儿。临床表现为反复腹泻、大便有较多泡沫、大便腥臭、腹部胀气、哭吵不安。本病的发生是由于乳糖酶数量不足或者活性低下，乳糖酶的作用在于将乳糖分解为半乳糖和葡萄糖。当乳糖酶数量不足或者活性低下时，乳糖不能有效的分解，在肠道中浓度较高，导致肠道PH值下降，肠蠕动增强。另外，乳糖是一种比较大的分子，浓度较高时肠腔渗透压增加，肠道内水分增多，所以导致腹泻。因此乳糖不耐受引起的腹泻是由于乳糖酶活性不足，益生菌不能调节乳糖酶的活性，起不到治疗作用。