胚胎着床晚有以下原因：一、病人如果表现出胚胎本身品质方面的问题，或者胚胎发育不良，可能会造成着床比较晚的现象，也可能会造成试管婴儿移植失败的现象。二、 冷冻胚胎着床和新鲜胚胎着床的时间是相差不多的，但是由于女性本身黄体机能不足，都可能会造成胚胎着床晚，因此应当及时补充黄体酮，可以有效的防止冷冻胚胎移植失败。三、表现出子宫方面的因素，也可能会造成冷冻胚胎着床晚，有的女性如果表现出子宫畸形，或者是子宫发育不良，都可能会造成这个疾病的产生，如果表现出了子宫壁过薄，都可能会影响到胚胎的正常着床。