感染扁平疣的主要原因可分为直接感染和间接感染还有病毒性感染。第一，直接感染是经过和人的直接接触来进行感染的，间接感染是指皮肤有轻微破损接触扁平疣病人的日常生活物品，使细菌进入皮肤和粘膜，皮细胞过度增殖，造成换上扁平疣。第二，病毒感染是扁平疣的主要原因，大部分扁平疣病人是突发性的。第三，免疫能力底下，扁平疣和自身免疫功能有一定关系。