三岁的宝宝牙痛有可能是有龋齿，可以带宝宝去医院牙科检查一下，如果确定是龋齿就需要及时地进行修补。由于宝宝六岁左右换牙，因此时间距离比较长，及时治疗以防宝宝遭受牙痛困扰。如果不是龋齿，也有可能是牙髓炎，医院检查的时候也可以确定的，建议在医生的指导下用药，不要盲目给宝宝吃药。