三个月宝宝掉头发可能是由于平时饮食不规律，造成营养不均衡导致的。也可能是平时在夜间经常哭闹或者晚上不肯睡觉，造成睡眠不足所引发的。而宝宝体内缺乏维生素以及微量元素也会造成掉头发。此外，如果宝宝在睡觉时出汗较多，并且枕头较硬，造成宝宝在睡觉时感到不适，经常转动，造成头部不适，长期的发生摩擦，也会表现出脱发的情况。建议家长及时带宝宝到医院进行检查治疗。