治疗头皮屑的抗真菌药物有酮康唑、氯咪巴唑、二硫化硒等，建议使用酮康唑来治疗，酮康唑在治疗头皮屑方面效果最好。酮康唑在低浓度时能抑制真菌麦角甾醇的合成，起到抑制马拉色菌繁殖的作用；高浓度时则直接破坏真菌细胞膜，表现出极强的杀菌效果。酮康唑对头皮蛋白有较高的亲和力，能在头皮表层快速形成保护膜，从而持续发挥作用。另外，酮康唑不存在透皮吸收，具有很高的安全性。