国内治疗简单低位瘘的手术方法大同小异，即将瘘管内外口全部切开，使创面完全开放，然后经过换药使创面达到愈合。治疗低位复杂瘘、高位肛瘘则因手术水平的差异而存在着很大区别。有的治疗低位复杂瘘的方法是将所有外口及管道全部切开。这样一来，创口虽然愈合了，但手术后的痛苦和瘫痕却是巨大的。而治疗各种高位肛瘘则采用传统的挂线术方法，虽然安全可靠，但挂线术同样存在着与传统手术方法类似的问题。此外，挂线术还有易复发和引起肛门沟状缺损的问题。