1、颁发机构不同：中医专长医师证书是由国家中医药管理局颁发的，而执业证书则是由各地卫生健康委员会或其下属的医疗机构颁发的。
2、适用范围不同：中医专长医师证书主要适用于中医专业领域的医师，而执业证书则适用于所有在医疗机构从事医疗、预防、保健等服务的医务人员。
3、考试内容不同：中医专长医师证书的考试内容主要是中医专业知识和技能，而执业证书的考试内容则包括医疗法律法规、医疗伦理、医疗技术知识等。
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4、职业发展路径不同：持有中医专长医师证书的医师可以申请开办中医诊所、参与科研项目等，而持有执业证书的医师则需要在医疗机构中按照医生的职责进行工作。
5、法律地位不同：中医专长医师证书的持有人在法律上享有一定的权益，如独立开展中医医疗活动、申请专利等，而执业证书的持有人则需要遵守医疗机构的各项规定，接受医疗机构的管理。
6、职业资格认证不同：中医专长医师证书是对个人中医专业技能的一种认证，而执业证书则是对医疗机构及其医务人员的一种认证。
7、培训要求不同：中医专长医师证书的培训通常需要通过专业的中医院校学习，而执业证书的培训则可以在医疗机构中进行，但需要满足一定的条件。
8、考试难度不同：中医专长医师证书的考试难度相对较大，需要具备较高的中医专业知识和技能水平，而执业证书的考试则相对容易一些。
中医专长医师证书与执业证书的主要区别在于颁发机构、适用范围、考试内容、职业发展路径、法律地位、职业资格认证、培训要求以及考试难度等方面，持有中医专长医师证书的医师在中医领域具有更高的专业性和权威性，而持有执业证书的医师则需要在医疗机构中按照医生的职责进行工作。
