中医专长医师资格证（简称“专长医师证”）与助理医师证是两种不同的医疗执业资格，它们的区别主要体现在以下几个方面：

一、定义和目的不同

1、专长医师证：这是针对具有一定中医临床经验和技术专长的医师所颁发的证书，持有此证的医师可以独立进行中医诊断和治疗。

2、助理医师证：这是针对尚未取得中医师资格证书的医师所颁发的证书，持有此证的医师在从事中医临床工作前需要经过进一步的培训和考核。

二、申请条件不同

1、专长医师证：申请者需要具备以下条件：

- 具有中医药学专业本科及以上学历；

- 具有5年以上的中医临床工作经验，并有2年以上的中医专科工作或教学经验；

- 通过中医医术实践能力考核，并经省、自治区、直辖市人民政府中医药主管部门组织的中医医术专长人员医术考核。

2、助理医师证：申请者需要具备以下条件：

- 具有医学专业本科及以上学历；

- 已通过国家统一的医学考试，取得执业医师资格证书；

- 在医疗机构实习一年以上，并通过相应的考核。

1、专长医师证通常包括：

- 中医基础理论；

- 中药学；

- 方剂学；

- 针灸学；

- 中医临床诊疗技能。

2、助理医师证通常包括：

- 医学基础知识；

- 临床医学基本知识；

- 医学伦理与法律知识；

- 医学心理学。

四、执业范围不同

1、专长医师证：持有此证的医师可以在注册后独立进行中医临床工作，包括诊断、治疗、开具处方等。

2、助理医师证：持有此证的医师需要在取得执业医师资格证书后，经过一定的培训和考核，才能在注册后独立进行中医临床工作。

五、执业期限不同

1、专长医师证：持有此证的医师可以自主选择执业地点，不受执业范围限制。

2、助理医师证：持有此证的医师需要在获得执业医师资格证书后，经过培训和考核，才能选择执业地点，并受到执业范围的限制。

六、培训和考核要求不同

1、专长医师证：持有此证的医师需要参加省级中医药主管部门组织的中医医术专长人员医术考核，并达到合格标准。

2、助理医师证：持有此证的医师需要参加国家统一的医学考试，并通过相应的考核。

中医专长医师资格证和助理医师证在定义、目的、申请条件、考试内容、执业范围、执业期限以及培训和考核要求等方面都存在显著差异，这些差异反映了中医行业对于不同层次医疗人才的需求和培养方向。