导致睡觉起床后腰痛的疾病有很多，可能是与泌尿系统有关的疾病或是与腰椎有关的疾病，建议到医院通过检查确诊。如果是泌尿系统疾病，需要使用抗菌消炎药物的药物治疗，并且注意清淡饮食、多休息避免太过劳累;如果是腰椎疾病，需要进行推拿、针灸等物理治疗。