药店营养师证的考核等级主要依据其专业技能、临床经验以及专业知识水平等因素综合决定，一般而言，一级营养师具备较全面的专业知识和丰富的实践经验，可以为患者提供专业的健康咨询服务，二级营养师则在一级的基础上，进一步提升了临床技能和理论水平。

具体来说，一级营养师需通过全国统一的考试和认证，获得营养师资格证书，之后还需要接受一定年限的实习期，然后才能正式成为一名营养师，一级营养师的专业技能包括基础营养知识、膳食指南、临床营养咨询等，临床经验则要求经过严格的实操培训，能够在实际工作中应用理论知识解决实际问题。

二级营养师除了具备了一级营养师的基本条件外，还需掌握更多的临床营养知识和技术，如儿童营养、糖尿病管理、妇女保健等领域，他们需要在实践中不断学习和提高，以适应医疗环境的变化和患者的需求。

药店营养师证的考核等级是一个综合的过程，旨在检验营养师的专业技能、临床经验和理论水平，以确保他们在提供健康服务的过程中能够做出正确的判断和决策。