心理咨询师证书是由国家权威机构进行颁发的，在中国，心理咨询师的职业资格认证主要由人力资源和社会保障部（原劳动和社会保障部）负责，根据《中华人民共和国职业分类大典》，心理咨询师被归类为专业技术人员，其职业资格认证分为三个等级：助理心理咨询师、心理咨询师和高级心理咨询师。

申请获取心理咨询师证书的过程通常包括理论学习、实操训练、案例分析以及严格的考试，学员需要通过专业的培训机构或大学的心理学课程进行系统的学习，掌握心理学基础知识、咨询技巧、心理评估方法等核心内容，在完成规定课时的学习后，学员需参加由人力资源和社会保障部指定的考试机构组织的统一考试，包括理论知识考试和实际操作技能考核两部分，只有当两项考试都达到合格标准后，才能获得相应级别的心理咨询师证书。

值得注意的是，近年来，随着行业的发展和政策调整，心理咨询行业的规范化管理也在逐步加强，一些地方可能会有更具体的管理和发证机构，例如省级人力资源和社会保障厅或者相关行业协会，但其背后的核心仍然是国家级别的认可和规范，为了保证服务质量，许多专业机构也会推荐或要求心理咨询师取得国际认可的证书，如美国心理咨询协会（APA）、英国心理咨询总会（BACP）等颁发的证书，这些证书的获取通常需要更高的专业素养和实践经验。

心理咨询师证书的颁发单位是国家层面的专业认证机构，而在具体的操作中，可能涉及到的地方性管理机构和国际认证机构也是提升专业水平的重要途径。