心理咨询师证书的发放机构在中国主要由两个权威部门进行：一是人力资源和社会保障部（原劳动和社会保障部），二是中国心理卫生协会。

人力资源和社会保障部颁发的心理咨询师职业资格证书，是中国官方承认的职业技能鉴定证书，这个证书的考试分为理论知识、专业技能和职业道德三部分，通过后可以获得国家认可的专业资格，这在求职、晋升以及行业内都有着重要的参考价值。

中国心理卫生协会则是非政府组织性质的专业团体，它颁发的是“注册心理师”或“心理咨询师”证书，这个证书的获取需要经过严格的学术背景审查、实习经历证明、专业能力评估等程序，因此含金量极高，尤其在学术研究和临床实践中受到广泛尊重。

值得注意的是，自2017年起，我国取消了心理咨询师的职业资格许可和认定，原有的心理咨询师职业资格证书停止发放，转而鼓励行业内的继续教育和专业认证，现在，人们更多地关注于接受系统的心理学教育培训，考取国际认可的心理学相关学位或者参加行业协会的专业认证，如美国心理学会（APA）、欧洲心理学会（EPS）等的认证，以提升自身的专业素养和市场竞争力。

虽然国内已不再发放统一的心理咨询师职业资格证书，但行业内部的专业认证依然重要且多元化，从业者可根据自身需求选择合适的途径提升自己的专业水平并获得相应的认证。