针灸师证书的颁发机构是由国家卫生健康委员会（原卫生部）及其授权的省级卫生健康行政部门进行的，在中国，针灸作为传统医学的重要组成部分，其专业技术人员的资格认证和管理有着严格的制度。

针灸师的职业技能培训和考核主要由各地的中医药继续教育基地或者具备相关资质的培训机构负责，这些机构需要经过国家或地方卫生健康行政部门的严格审批，确保教学内容符合国家规定的标准和要求。

完成培训后，学员需参加全国统一的中医类别医师资格考试，其中包括中医基础理论、中医诊断学、中药学、方剂学、针灸学等科目，通过考试者将获得《中医执业助理医师资格证书》或《中医执业医师资格证书》。

取得医师资格证书的人员，还需要在医疗机构实习满一定年限，并通过医疗机构所在地的卫生健康行政部门的注册，才能获取《医师执业证书》，这标志着他们正式成为合法的医疗工作者，可以从事针灸诊疗工作。

对于有更高专业水平和丰富临床经验的针灸从业者，还可以申请高级职称评定，如副主任医师、主任医师等，这类职称证书一般由人力资源和社会保障部门颁发，是对针灸师专业能力的进一步认可。

针灸师证书的颁发是一个严谨且系统的过程，涉及到卫生健康行政部门、教育培训机构以及人力资源部门等多个环节，以保证针灸服务的专业性和安全性，这也体现了我国对传统医学的重视与保护，以及对公众健康权益的保障。