中医针灸理疗师的资格认证是由国家卫生健康委员会及其授权的相关部门进行颁发的，在中国，针灸作为传统医学的重要组成部分，其专业人员的资质认定和管理非常严谨。

中国有明确的法律法规对中医针灸行业进行规范，如《中华人民共和国执业医师法》、《中医药条例》等，这些法规为针灸理疗师的资格认证提供了法律依据，在这些法规的基础上，国家卫生健康委员会制定了详细的针灸理疗师职业标准和考试制度。

国家卫生健康委员会会定期组织或委托相关权威机构进行中医针灸理疗师的职业技能鉴定和考核，通过理论知识测试和实践操作考核，合格者将获得由国家卫生健康委员会统一印制并颁发的“中医针灸理疗师”职业资格证书，这个证书在全国范围内有效，是从业者从事中医针灸理疗工作的法定凭证。

各地的卫生健康行政部门也会根据实际情况，配合国家政策，对本地的中医针灸理疗师进行管理和监督，他们可能会设立地方性的培训和考核机制，以确保针灸服务的质量和安全。

中医针灸理疗师证书的颁发机构主要是国家卫生健康委员会，同时也包括其授权的地方卫生健康行政部门，这样的体系既保证了针灸行业的规范化，又保障了公众接受到的专业、安全的医疗服务，对于从业人员而言，获取这一证书不仅是对他们专业技能的认可，也是他们合法从业的重要保障。